L’effectif exact de la population de dugongs à Mayotte est méconnu, mais ne dépasserait pas la dizaine d’individus. Chaque décès est critique et chaque naissance est exceptionnelle pour la conservation des dugongs à Mayotte.

La population de dugongs de Mayotte a été relativement abondante par le passé et la cause majeure de son déclin a été sa surpêche. Le dugong est protégé depuis 1995 et depuis 1997 l’utilisation du filet est réglementée dans le lagon de Mayotte. Malgré ces mesures de protection, quelques captures accidentelles de dugongs ont été recensées au cours de ces 10 dernières années et suffisent à menacer la population à très court terme. Viennent s’y ajouter des pressions humaines plus récentes mais en expansion : le trafic maritime qui entraîne des risques de collision, la dégradation des habitats de l’espèce dont la diminution de la qualité des eaux côtières et la détérioration des herbiers à phanérogames marines, ainsi que la pollution acoustique.

Depuis 2021, un second plan national d’action (PNA) destiné à prévenir le déclin des dugongs a été mis en place par le Ministère de la Transition Écologique. Celui-ci veille à poursuivre les efforts en faveur de la conservation du dugong, il comprend 2 objectifs : limiter la mortalité des individus et améliorer les connaissances sur l’espèce et ses habitats pour la mise en place d’une gestion pertinente. Animé par l’association Naturalistes Environnement et Patrimoine de Mayotte, ce PNA est effectif sur la période 2021-2025.