Le continuum terre-mer est le lien entre les actions ayant lieu sur terre et l’impact qu’elles ont en mer.
En partenariat avec le Bureau de recherches géologiques et minières (BRGM), l’Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer (IFREMER) et la Direction de l’environnement de l’aménagement et du logement (DEAL), le Parc travaille sur un projet ambitieux, s’étalant sur trois ans, et visant à mieux comprendre le comportement des contaminants chimiques de l’amont de trois bassins versants jusqu’au récif barrière. 
Cette étude a pour objectif d’améliorer la connaissance des pressions qui pèsent sur les masses d’eau et du comportement des substances chimiques le long du continuum terre-mer, mais aussi d’élargir le spectre des substances recherchées à Mayotte.