Les premiers élevages, d’ombrines tropicales (Sciaenops ocellatus) essentiellement, ont été installés à Mayotte en 1999 et la commercialisation a débutée en 2001. Après une forte croissance de 2001 à 2003, la production s’est stabilisée puis a périclité en partie à cause de problèmes structurels d’organisation de la filière et des contraintes liées à l’approvisionnement en juvéniles et en aliments. Les entreprises étaient situées à Longoni et en baie d’Hajangua et l’on peut encore aujourd’hui voir les cages aquacoles dans le lagon.
A ce jour, des projets de relance de la filière sont à l’étude.