Le choix de l’endroit pour creuser son nid dépendra aussi des obstacles qu’elle rencontrera. Des rochers, des racines, ou des déchets pourront lui faire changer de direction.
Lorsqu’elle aura identifié l’endroit approprié, la tortue commencera à creuser un grand trou à l’aide de ses nageoires avant, c’est la cavité corporelle. Elle creusera ensuite un plus petit trou, le puits de ponte, où elle déposera environ 120 œufs. Une fois son trou rebouché, elle retournera vers l’océan en se repérant grâce au reflet de la lune sur l’eau. La tortue pourra pondre 4 à 8 fois en l’espace de 10 à 15 jours.

Sur certaines plages de Mayotte, on trouvera à la fois des nids en haut de plage et des tortues s’alimentant sur l’herbier. Pourtant, les tortues qui s’alimentent sur une zone n’y pondront pas. Grandes migratrices, elles devront parcourir de très longues distances, parfois des milliers de kilomètres, pour retrouver la région où elles sont nées et y pondre. En revanche, la zone d’accouplement en mer est proche de la plage de ponte.